理论上厌氧池比好氧池更需要加热，因为厌氧反应需要的温度更高，即便是中温消化也需要保证水温在35摄氏度以上。实际上厌氧池保温反而比好氧池轻松，毕竟厌氧反应本身就放热，而且厌氧池很少露天建造，建成时便自带隔热环境。好氧池理论上维持在10摄氏度就能运行，但硝化细菌对温度的要求比普通好氧菌更高，长时间在这种温度下运行很可能影响出水氨氮，所以还得花点力气在保温上。我国中部地区的污水厂是最纠结的，建造时如果专门做了防寒设施，预算会多出一截，而且可能用不上几次，但不做防寒的话又会被可能到来的冷冬打个措手不及。
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